پیشرفت‌های اخیر در فناوری‌های توالی ژنوم موجب پدید آمدن انبوهی از داده‌های زیستی شده است. این امر فرصت طراحی مدل‌های محاسباتی برای پیش‌بینی دقیق پدیده‌های پیچیده زیستی در موجودات زنده را فراهم آورده است. آزمایشگاه بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی سامانه‌ای از سال ۱۳۹۱ شروع به فعالیت کرده و هدف اصلی آن، استنباط و بهره‌گیری از مدل‌های محاسباتی بر پایه علوم ریاضی، آمار و علوم کامپیوتر به‌‌منظور مدل‌سازی شبکه‌های پیچیده زیستی است. در این آزمایشگاه با به‌کارگیری روش‌های نوین نظریه گراف، الگوریتم‌های ترکیبیاتی، یادگیری ماشین، داده‌کاوی، الگوریتم‌های فرااکتشافی، استنباط‌های آماری، شبیه‌سازی دینامیک مولکولی و شبیه‌سازی داکینگ مولکولی به حل مسائل زیستی می‌پردازیم. برخی از پروژه‌های فعلی این گروه، پیشنهاد درمان‌های شخصی برای سرطان، کشف زیر نوع‌های سرطان، بازنمایی دارو، کشف تعاملات بین دارویی، تعیین دامنه‌های پروتئینی و پیش‌بینی کامپلکس‌های پروتئینی است. علاوه‌‌ بر برگزاری سمینارها، ورکشاپ‌ها و کارگاه‌های عملی، این گروه با نهادهای مختلفی از جمله دانشگاه تهران و مراکز تحقیقاتی متعددی مانند پژوهشگاه دانش‌های بنیادی و پژوهشکده بیوشیمی و بیوفیزیک، پژوهشگاه رویان و مرکز مهندسی ژنتیک همکاری داشته و تعامل متقابلی با پژوهشگران نهادهای بین‌المللی نظیر دانشگاه‌های زیر برقرار کرده است:
 

National University of Singapore, Beijing University of China, Shenzhen University, Rutgers University of America, University of Arkansas for Medical Sciences and Cochin Institute in France