دكترا, رياضي, دانشگاه صنعتي شريف - تهران, ايران.

1. الگوريتم هاي تركيباتي در بيوانفورماتيك (دكتري)

2. سيستم بيولوژي (دكتري)

3. الگوريتم هاي تركيبياتي در بيوانفورماتيك (كارشناسي ارشد)

4. سمينار (كارشناسي ارشد)

1. الگوريتم هاي تركيباتي در بيوانفورماتيك (دكتري)

2. الگوريتم هاي فرا - اكتشافي در بيوانفورماتيك (دكتري)

3. بازشناسي الگو (دكتري)

4. بيوانفورماتيك (دكتري)

5. درخت‌ها و شبكه‌هاي فيلوژنتيك (دكتري)

6. رياضيات زيستي (دكتري)

7. رياضيات زيستي پيشرفته (دكتري)

8. سيستم بيولوژي (دكتري)

9. كاربرد نظريه گراف در بيوانفورماتيك (دكتري)

10. مباحث ويژه در مدل سازي كاركردها و رفتارهاي شناختي 1 (دكتري)

11. مباحثي در تركيبيات (دكتري)

12. مباحثي در تركيبيات و نظريه گراف (دكتري)

13. جبر 1 (كارشناسي)

14. جبر خطي (كارشناسي)

15. جبرخطي 1 براي آمار (كارشناسي)

16. رياضي پيش نياز (كارشناسي)

17. رياضيات عمومي 1 (كارشناسي)

18. رياضيات گسسته (كارشناسي)

19. مباحثي در علوم كامپيوتر (كارشناسي)

20. مباني بيوانفورماتيك (كارشناسي)

21. مباني تركيبيات (كارشناسي)

22. مباني جبر (كارشناسي)

23. مباني علوم رياضي (كارشناسي)

24. نظريه اعداد (كارشناسي)

25. نظريه گراف و كاربردهاي آن * (كارشناسي)

26. نظريه مقدماتي اعداد (كارشناسي)

27. آناليز تركيباتي 1 (كارشناسي ارشد)

28. آناليز تركيبي (كارشناسي ارشد)

29. الگوريتم هاي تركيبياتي در بيوانفورماتيك (كارشناسي ارشد)

30. الگوريتم هاي فرااكتشافي (كارشناسي ارشد)

31. رياضيات پيشرفته (كارشناسي ارشد)

32. سمينار (كارشناسي ارشد)

33. مباحث ويژه در داده كاوي (كارشناسي ارشد)

34. نظريه الگوريتم-پيشرفته (كارشناسي ارشد)

35. نظريه گراف (كارشناسي ارشد)

1. A. A. maddi, F. Ahmadi moughari, M. Balouchi, C. Eslahchi, "CDAP: An Online Package for Evaluation of Complex Detection Methods" , Scientific Reports, Vol.9, pp.1-13, 2019.

2. N. Rohani, C. Eslahchi, "Drug-Drug Interaction Predicting by Neural Network Using Integrated Similarity" , Scientific Reports, Vol.9, pp.1-11, 2019.

3. A. Emdadi, F. Ahmadi moughari, F. Yassaee, C. Eslahchi, "A novel algorithm for parameter estimation of Hidden Markov Model inspired by Ant Colony Optimization" , Heliyon, Vol.5, pp.1-25, 2019.

4. E. Mirzaei mehrabad, R. Hassanzadeh, C. Eslahchi, "PMLPR A novel method for predicting subcellular localization based on recommender systems" , Scientific Reports, Vol.8, pp.1-10, 2018.

5. A. Maddi, C. Eslahchi, "Discovering overlapped protein complexes from weighted PPI networks by removing inter-module hubs" , Scientific Reports, Vol.7, pp.3247-3261, 2017.

6. A. Rezvan, C. Eslahchi, "Comparison of different approaches for identifying subnetworks in metabolic networks" , Journal of Bioinformatics and Computational Biology, Vol.15, pp.1750025-1750050, 2017.

7. L. Wong, S. Jahangiri tazehkand, C. Eslahchi, "OrthoGNC A Software for Accurate Identification of Orthologs Based on Gene Neighborhood Conservation" , GENOMICS PROTEOMICS and BIOINFORMATICS, Vol.15, pp.361-370, 2017.

8. N. Sammaknejad, H. Pouretemad, C. Eslahchi, A. Salahirad, A. Alinejad, "Gender Classification Based on Eye Movements A Processing Effect during Passive Face Viewing" , Advances in Cognitive Psychology, Vol.13, pp.232-240, 2017.

9. M. Sadeghi damavandi, R. KH., F. Bakouie, H. Mahdavi, C. Eslahchi, H. Pouretemad, "Screening of autism based on task-free fMRI using graph theoretical approach" , PSYCHIATRY RESEARCH-NEUROIMAGING, Vol.1, pp.48-56, 2017.

10. F. Movahedi, C. Eslahchi, M. Pourbarat, M. Shahrokhi-dehkordi, "Analysis of dynamical system to transition probabilities in the Birth-Death Markov process in the epidemic model" , Far East Journal of Dynamical Systems, Vol.26, pp.61-74, 2015.

11. R. Aghdam, M. Alijanpour ghahroud, M. Azadi, A. Ebrahimi, C. Eslahchi, A. Rezvan, "Inferring Gene Regulatory Networks by PCA-CMI Using Hill Climbing Algorithm Based on MIT Score and SORDER Method" , International Journal of Biomathematics, Vol.18, pp.23-44, 2015.

12. R. Aghdam, M. Ganjali, P. N., C. Eslahchi, "Inferring gene regulatory networks by an order independent algorithm using incomplete data sets" , JOURNAL OF APPLIED STATISTICS, Vol.43, pp.893-913, 2015.

13. M. Akbari, C. Eslahchi, N. Jafari, R. Hassani, "Some Remarks On Global Total Domination In Graphs" , Applied Mathematics E - Notes, Vol.15, pp.22-28, 2015.

14. H. Poormohammadi, C. Eslahchi, R. Toyserkani, "TripNet A Method for Constructing Rooted Phylogenetic Networks from Rooted Triplets" , PLoS One, Vol.9, pp.1-12, 2014.

15. R. Hassanzadeh, C. Eslahchi, W. Sung, "Do Triplets Have Enough Information to Construct the Multi-Labeled Phylogenetic Tree" , PLoS One, Vol.9, pp.1-10, 2014.

16. R. Aghdam, M. Ganjali, C. Eslahchi, "IPCA-CMI An Algorithm for Inferring Gene Regulatory Networks based on a Combination of PCA-CMI and MITScore" , PLoS One, Vol.9, pp.1-10, 2014.

17. R. Aghdam, M. Ganjali, X. Zhang, C. Eslahchi, "CN A Consensus Algorithm for Inferring Gene Regulatory Networks Using SORDER Algorithm and Conditional Mutual Information Test" , Molecular BioSystems, pp.942-949, 2014.

18. C. Eslahchi, A. Ansari, "A New Protein Domain Assignment Algorithm Based on the Dominating Set of a Graph" , MATCH-COMMUNICATIONS IN MATHEMATICAL AND IN COMPUTER CHEMISTRY, Vol.71, pp.445-456, 2014.

19. E. Ansari, C. Eslahchi, H. Pezeshk, M. Sadeghi, "ProDomAs protein domain assignment algorithm using center-based clustering and independent dominating set" , PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, Vol.82, pp.1-10, 2014.

20. G. Taheri, M. Ayati, C. Eslahchi, . Limsoon, "Two Scenarios for Overcoming Drug Resistance by Co-Targeting" , International Journal of Bioinformatics Research and Applications, Vol.9, pp.198-217, 2013.

21. G. Taheri, M. Habibi, C. Eslahchi, W. Limsoon, "DISRUPTION OF PROTEIN COMPLEXES" , Journal of Bioinformatics and Computational Biology, Vol.11, pp.1341008-1-1341008-13, 2013.

22. S. Safikhani, M. Sadeghi, C. Eslahchi, H. Pezeshk, "SSP An interval integer linear programming for de novo transcriptome assembly and isoform discovery of RNA-seq reads" , GENOMICS, Vol.102, pp.507-514, 2013.

23. V. Rezaee, H. Pezeshk, C. Eslahchi, M. Sadeghi, "Assignment of Protein Sequences to Protein Family Profiles Using Spatial Statistics" , MATCH-COMMUNICATIONS IN MATHEMATICAL AND IN COMPUTER CHEMISTRY, Vol.69, pp.7-24, 2013.

24. R. Aghdam, H. Pezeshk, A. M., S. SH., C. Eslahchi, "A clustering approach for estimating parameters of a profile hidden Markov model" , International Journal of Data Mining and Bioinformatics, Vol.8, pp.66-75, 2013.

25. C. Eslahchi, "Discovering Domains Mediating Protein Interactions" , Iranian Journal of Biotechnology, Vol.11, 2012.

26. H. Poormohammadi, C. Eslahchi, "Constructing Rooted Phylogenetic Networks from Triplets based on Height Function" , International Journal of Emerging Technology and Advanced Engineering, Vol.2, 2012.

27. V. Rezaee, S. N., H. Pezeshk, M. Sadeghi, C. Eslahchi, "Comparison of the bidirectional Baum-Welch algorithm and the Baum-Welch algorithm on regular lattice" , PROGRESS IN BIOLOGICAL SCIENCES, Vol.2, pp.14-22, 2012.

28. A. Alimadadi, C. Eslahchi, N. J., "A Note on the total Domination supercritical Graphs" , AAPS PHARMSCI, Vol.1, 2012.

29. A. Alimadadi, C. Eslahchi, T. H., N. J., V. L., "Erratum to Total domination supercritical graphs with respect to relative complements Discrete Math.2582002) 361-371" , DISCRETE MATHEMATICS, Vol.312, pp.1-10, 2012.

30. A. Ebrahimi, R. Aghdam, P. Niloofar, M. Ganjali, C. Eslahchi, "LSPC An Algorithm for Inference of Gene Networks Using Bayesian Network" , AATCC REVIEW, Vol.3, pp.774-782, 2012.

31. C. Eslahchi, F. Movahedi, "Calculation of transition probabilities in the birth and death Markov process in the epidemic model" , MATHEMATICAL AND COMPUTER MODELLING, Vol.55, pp.810-815, 2012.

32. C. Eslahchi, R. Hassanzadeh, A. Mottaghi, M. Habibi, H. Pezeshk, M. Sadeghi, "Construcing circular phlogenetic networks from weighted quartets using simulated annealing" , MATHEMATICAL BIOSCIENCES, pp.123-127, 2012.

33. R. Hassanzadeh, C. Eslahchi, "Constructing phylogenetic supernetworks based on simulated annealing" , MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, Vol.63, pp.738-744, 2012.

34. A. Ebrahimi, R. Aghdam, P. Niloofar, M. Ganjali, C. Eslahchi, "A Bidirectional Bayesian Monte Carlo Approach for Estimating Parameters of a Profile Hidden Markov Model" , AAPG BULLETIN, Vol.2, pp.1-10, 2011.

35. C. Eslahchi, A. Katanforoush, N. Afzaly, H. Pezeshk, "Haplotype block partitioning and tagSNP selection under the perfect phylogeny model" , Iranian Journal of Biotechnology, Vol.9, pp.1209-1221, 2011.

36. C. Eslahchi, S. Alikhani, M. Akbari, "Hosoya Polynomial of an Infinite Family of Dendrimer" , Iranian journal of mathematical chemistry, Vol.2, pp.71-79, 2011.

37. C. Eslahchi, SH. Haghighi, N. J., "A note on the Total Irredundance in Regular Graphs" , Australian journal of basic and applied sciences (), Vol.9, pp.1999-2001, 2011.

38. M. A., C. Eslahchi, N. Jafari, R. Hassani, "Outer-k-connected component domination in graphs" , GRAPHS AND COMBINATORICS, Vol.8, pp.131-139, 2011.

39. M. Habibi, C. Eslahchi, H. Pezeshk, M. Sadeghi, "An Information Theoretic Approach to Secondary Structure Assignment" , MATCH-COMMUNICATIONS IN MATHEMATICAL AND IN COMPUTER CHEMISTRY, 2011.

40. C. Eslahchi, M. Habibi, A. Mottaghi, R. Hassanzadeh, "MCNet A method for the construction of phylogenetic networks based on the Monte-Carlo method" , BMC EVOLUTIONARY BIOLOGY, pp.254-264, 2010.

41. SH. Arab, M. Sadeghi, C. Eslahchi, H. Pezeshk, A. SH., "A pairwise residue contact area based mean force potential for discrimination of native protein structure" , BMC BIOINFORMATICS, Vol.16, 2010.

42. C. Eslahchi, "An Algorithm for Construction of all Perfect Phylogeny Matrices" , MATCH-COMMUNICATIONS IN MATHEMATICAL AND IN COMPUTER CHEMISTRY, Vol.62, pp.251-259, 2009.

43. M. Miirzaie, C. Eslahchi, H. Pezeshk, "A Distance Dependent Atomic Knowledge Based Potential and Force for Discrimination of Native Structures from Decoys" , PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, Vol.77, pp.454-464, 2009.

44. C. Eslahchi, A. S., "A Tale of two Symmetrical Tails Structural and Functional Charateristics of Palindroms in Proteins" , BMC BIOINFORMATICS, Vol.9, pp.274-281, 2008.

45. C. Eslahchi, A. Rahimi, "The k-Zero-Divisor Hypergraph of A Commutative Ring" , International Journal of Mathematics and Mathematical Sciences, pp.1-15, 2007.

46. C. Eslahchi, A. Rahimi, "Some Properties Of Ordered Hypergraphs" , Matematicki Vesnik, Vol.59, pp.9-13, 2007.

47. C. Eslahchi, F. D., "An Algorithm for Rank Aggregation Problem" , APPLIED MATHEMATICS AND COMPUTATION, Vol.189, pp.1847-1858, 2007.

48. SH. Arab, F. D., C. Eslahchi, "Helix segment assignment in proteins using fuzzy logic" , Iranian Journal of Biotechnology, Vol.5, 2007.

49. S. A., H. Goudarzi, M. Sadeghi, C. Eslahchi, "Importance of RNA secondary structure information for yeast donor and acceptor splic site prediction by neural networks" , COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY, Vol.30, pp.50-57, 2006.

50. C. Eslahchi, A. Rafati, "Circular chromatic number of hypergraphs" , Journal of Ars Combinatorics, Vol.73, pp.239-246, 2004.

51. C. Eslahchi, "A Counterexample for Hilton- Jojnson s Conjecture on List-Coloring of Graphs" , Australasian Journal of Combinatorics, pp.127-131, 1998.

52. س. شعباني مشكول, ا. بهرامي ساماني, چ. اصلاحچي, "برازش يك مدل رگرسيون پواسوني بر نتايج فوتبال ليگ برتر ايران" , مجله ي بررسي هاي آمار رسمي ايران, نسخه 21, صفحات:230-237, 1390.

1. H. Pezeshk, S. N., S. Malekpour, C. Eslahchi, M. Sadeghi, "A modified biodirectional hidden markov model and its appliction in protein secondary structure prediction" , In Ieee 2010, 2010.

2. M. Ayati, G. Taheri, SH. Arab, C. Eslahchi, L. V., "Ovwercoming dRug resistance by cotrageting" , In IEEE(BIBM)2010, 2010.

3. C. Eslahchi, H. Pezeshk, M. Sadeghi, N. Afzali, A. Katanforoush, "Haplotype block partitioning and tagsnp selection under the perfect phylogeny" , In (tcwmc 2010) the third conference and workshop on mathematical chemistry, 2010.

4. S. Ahmadian, S. M., M. Sadeghi, H. Pezeshk, C. Eslahchi, "Construction of random perfect phylogeny matrix" , In (tcwmc 2010) the third conference and workshop on mathematical chemistry, 2010.

5. C. Eslahchi, M. Habibi, R. Hassanzadeh, A. Mottaghi, "Mc net a monte carlo method for the construction of phylogentic networks" , In 4th international conference on resarch and education in mthematics, 2009.

6. C. Eslahchi, "Haplotyping problem A clustering approach" , In International conference of numerical analysis and applied mathematics 2007(ICNAAM 2007), 2007.

7. C. Eslahchi, "Hyplotyping problem a cclustering approach" , In International society for computational biology, 2007.

8. س. كتانفروش, چ. اصلاحچي, "يك الگوريتم ژنتيك براي استنباط هاپلوتيپ ها" دهمين كنفرانس سيستم هاي فازي ايران, 1389.

9. چ. اصلاحچي, "بررسي پيچيدگي توالي هاي آيينه اي در پروتئين ها" پنجمين همايش ملي بيوتكنولوژي جمهوري اسلامي ايران, 1386.

10. چ. اصلاحچي, "روشي جديد بري نسبت دادن ساختار دوم پروتئين بر اساس روابط رياضياتي بين مختصات سه بعديcaها" پنجمين همايش ملي بيوتكنولوژي جمهوري اسلامي ايران, 1386.

11. چ. اصلاحچي, ح. پزشك, "الگوريتمي براي پلاك بندي هاپلوتيپ ها بر مبناي درخت هاي فيلوژنتيك كامل" پنجمين همايش ملي بيوتكنولوژي جمهوري اسلامي ايران, 1386.

12. چ. اصلاحچي, ح. پزشك, م. حبيبي, "تخصيص ساختمان دوم پروتئين با استفاده از انتروپي" پنجمين همايش ملي بيوتكنولوژي جمهوري اسلامي ايران, 1386.

13. ح. پزشك, چ. اصلاحچي, م. صادقي, ا. ملك پور, "تركيبي از مدل هاي ماركفي پنهان و شبكه هاي عصبي براي تعيين ساختار دوم پروتئين ها" پنجمين همايش ملي بيوتكنولوژي جمهوري اسلامي ايران, 1386.

14. ش. عرب سيد, چ. اصلاحچي, "ston روشي جديد براي مقايسه ساختمان سه بعدي پروتئينها" پنجمين همايش ملي بيوتكنولوژي جمهوري اسلامي ايران, 1386.

15. ل. پيرحاجي, م. صادقي, م. كارگر, آ. شعاري, ه. پورمحمدي, ح. پزشك, چ. اصلاحچي, "شناسايي الگوها در توالي هاي زيستي با استفاده از آماره مربع كاي و روش هاي مبتني بر اندازه گيري" پنجمين همايش ملي بيوتكنولوژي جمهوري اسلامي ايران, 1386.

16. م. كارگر, ح. پزشك, ه. پورمحمدي, ل. پيرحاجي, چ. اصلاحچي, "الگوريتم خوشه بندي براي مساله بازسازي هاپلو تايپ ها" پنجمين همايش ملي بيوتكنولوژي جمهوري اسلامي ايران, 1386.

17. ه. پورمحمدي, ح. پزشك, م. كارگر, چ. اصلاحچي, "الگوريتم حريصانه براي مساله تشخيص كمترين تعداد هاپلوتايپ ها از ژنو تايپ ها" پنجمين همايش ملي بيوتكنولوژي جمهوري اسلامي ايران, 1386.